清热燥湿：可用于湿温、暑湿，症见胸闷、恶心呕吐、身热不扬等，也能治疗湿热泻痢、黄疸、带下等多种湿热病症。
泻火解毒：能清实热、泻肺火，用于热病高热烦渴，也可治疗肺热咳嗽、咽喉肿痛、热毒疮疡等。
止血：对于血热导致的吐血、衄血、便血、崩漏等出血症状有止血作用。
安胎：可用于治疗血热胎动不安。
其他作用：现代研究表明，黄芩还有抗菌、抗病毒、抗炎、抗过敏、抗氧化、保肝等作用。
副作用损伤脾胃：性寒，脾胃虚寒者服用可能加重症状，出现腹痛、腹泻、大便稀溏等。
引发过敏：对黄芩过敏者服用后可能出现皮肤瘙痒、起水泡样药疹等，严重者可能出现过敏性休克。
中毒反应：长期大量服用可能引起中毒，出现恶心、呕吐、食欲下降等症状。
神经兴奋：部分人群服用后可能出现失眠多梦、烦躁不安等神经兴奋症状。
配伍炮制常用配伍：黄芩配半夏可治痰热互结之咳嗽痰黄稠且多、少阳证等；配黄连能增强清热燥湿、泻火解毒效果，用于上、中二焦热盛病症；配防风可治肝经风热所致血崩、便血等；配升麻可用于积热在肠所致泻利、脱肛；配栀子能清三焦肺热，治疗火热表里俱盛、湿热黄疸等。
炮制方法：炒黄芩是取黄芩片文火炒至深黄色微有焦斑；酒黄芩是黄芩片用黄酒拌匀闷润后炒干，可清上焦湿热；黄芩炭是炒至表面黑褐色，用于止血；姜黄芩是用姜汁拌匀炒干，可和胃止呕；蜜黄芩是用蜜炙，可缓和苦寒之性，润肺止咳。
用法用量内服：煎汤，常用量为 3-10 克；或入丸、散。
外用：适量，煎水洗或研末调敷。
特殊功效及主治病症清上焦热要药：尤其善于清除肺经之热，对于肺热咳嗽、咳痰黄稠等有特效，是治疗肺热病症的常用药。
治疗胎动不安：针对血热导致的胎动不安，有很好的安胎作用，常与其他养血滋阴、补肾安胎药同用。
治疗湿热黄疸：与茵陈、栀子等配伍，可通过清热燥湿、利胆退黄，有效治疗湿热蕴结肝胆所致的黄疸。
常用方剂黄芩滑石汤：出自《温病条辨》，由黄芩、滑石、蔻仁、通草、猪苓、茯苓、大腹皮组成，用于治疗湿温身热。
黄芩泻肺汤：出自《张氏医通》，含黄芩、大黄、连翘、山栀、苦杏仁、枳壳、桔梗、薄荷、生甘草，可治肺热喘嗽，里实便秘。
黄芩汤：出自《伤寒论》，由黄芩、芍药、甘草、大枣组成，主治太阳、少阳合病下利。
半夏泻心汤：出自《伤寒论》，含黄芩、半夏、黄连、干姜等，能寒热平调，消痞散结，用于寒热错杂之痞证。
葛根黄芩黄连汤：出自《伤寒论》，由葛根、黄芩、黄连、甘草组成，可解表清里，用于协热下利。
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